學校以醫(yī)學學科為主，現(xiàn)有6個自治區(qū)“十三五”重點學科，其中2個高峰學科、4個高原學科；臨床醫(yī)學學科進入ESI全球排名前1%；5個一級學科博士學位授權(quán)點，2個專業(yè)學位博士授權(quán)點；10個一級學科碩士學位授權(quán)點，8個專業(yè)學位碩士授權(quán)點；2個博士后科研工作站、3個博士后科研流動站。

學校立足新疆及周邊地區(qū)重大疾病、特高發(fā)疾病防治和區(qū)域特殊藥物資源開發(fā)開展研究，成績斐然。2018年，獲得科研項目379項，經(jīng)費6914.88萬元，縱向項目359項，經(jīng)費6566.18萬元，橫向項目20項，經(jīng)費348.7萬元。其中，獲得國家自然科學基金重點項目資助1項，直接經(jīng)費294萬元，是新疆高校2018年獲得的唯一一項重點項目。2018年，公開發(fā)表學術(shù)論文3012篇，發(fā)表SCI論文499篇，較上年增長59.93%。在國際頂尖學術(shù)期刊《Science》雜志發(fā)表與武漢大學最新合作成果，影響因子高達41.058，實現(xiàn)新疆生命醫(yī)學研究領(lǐng)域重大突破。自治區(qū)科技進步獎數(shù)量連續(xù)十年蟬聯(lián)全疆高校第一，2018年獲自治區(qū)科技獎14項，其中一等獎3項、二等獎6項、三等獎5項。

學校共有實習基地134家，其中直屬附屬醫(yī)院6所，非隸屬附屬醫(yī)院6所。學校臨床教學及實習基地集中了全疆優(yōu)質(zhì)資源、優(yōu)勢凸顯，初步實現(xiàn)了“小病不出鄉(xiāng)、大病不出縣、疑難危重病不出疆”的目標。學校6所直屬附屬醫(yī)院均為三級甲等醫(yī)院、臨床醫(yī)學院，開放床位數(shù)近一萬余張，其中第一附屬醫(yī)院在2017-2018年“中國頂級醫(yī)院競爭力100強名單”中名列第55位；第二附屬醫(yī)院是國家老年疾病臨床醫(yī)學研究中心新疆分中心；第三附屬醫(yī)院是國家癌癥中心新疆分中心；第四附屬醫(yī)院是國家中醫(yī)臨床研究基地、國家中醫(yī)藥國際合作基地；第五附屬醫(yī)院是中國婦女發(fā)展基金會“母親微笑行動”定點醫(yī)院；第六附屬醫(yī)院是新疆醫(yī)科大學中亞骨科中心。

學校不斷加強與國內(nèi)外知名高校的交流合作。2011年教育部確定中南大學、吉林大學、北京中醫(yī)藥大學為我校全面對口支援高校，同時還與復(fù)旦大學、中山大學、中國藥科大學等20余所大學建立了長期援疆共建合作關(guān)系，各高校選派援疆干部專家實施精準援疆、目標援疆、團隊援疆等形式，促進了學校辦學水平的全面提升。

學校與美、俄、日、英、法、德、巴基斯坦等多個國家的大學及研究機構(gòu)建立了校際合作關(guān)系。特別是近幾年來，學校國際教育的規(guī)模和質(zhì)量不斷提升，學歷被阿聯(lián)酋、沙特、巴基斯坦、巴林等多個國家認可。目前，學校有含博士、碩士、本科層次學歷教育留學生564人，被教育部授予首批接受政府獎學金的高校、來華留學生教育先進集體。2011年被批準成為自治區(qū)首批來疆留學高校示范基地。

依托現(xiàn)有12個國家臨床重點專科和85個自治區(qū)臨床重點?？?，學校在周邊國家及地區(qū)的影響力明顯增強，為絲綢之路經(jīng)濟帶核心區(qū)建設(shè)做出了突出貢獻。

立足新時代，開啟新征程，新疆醫(yī)科大學將高舉習近平新時代中國特色社會主義思想的偉大旗幟，緊緊圍繞立德樹人的根本任務(wù)，肩負“健康中國”的歷史使命，不忘初心、矢志奉獻，努力打造集醫(yī)學教育、醫(yī)療服務(wù)、醫(yī)學研究、健康產(chǎn)業(yè)“四位一體”的航空母艦，為新疆社會穩(wěn)定和長治久安，為中華民族偉大復(fù)興努力奮斗。