學(xué)校前身是1926年創(chuàng)辦于上海的私立東南醫(yī)科大學(xué)，1930年更名為東南醫(yī)學(xué)院，1949年底響應(yīng)中共中央華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”號(hào)召，內(nèi)遷安徽懷遠(yuǎn)，成為安徽省第一所高等醫(yī)科院校。1952年遷址合肥，改名為安徽醫(yī)學(xué)院。1985年更名為安徽醫(yī)科大學(xué)。

學(xué)校將現(xiàn)代著名教育家蔡元培先生的題詞“好學(xué)力行，造就良醫(yī)”確立為校訓(xùn)，將“厚德至善，博學(xué)濟(jì)世”確立為校風(fēng)，弘揚(yáng)“愛(ài)國(guó)愛(ài)民，獻(xiàn)身人類健康”的光榮傳統(tǒng)，秉承“興國(guó)、奉獻(xiàn)、仁愛(ài)”的育人理念，倡導(dǎo)踐行“崇教、樂(lè)教、善教”教風(fēng)和“求真、求精、求新”學(xué)風(fēng)，致力于建設(shè)高水平醫(yī)科大學(xué)。

學(xué)?，F(xiàn)有梅山路校區(qū)、翡翠路校區(qū)、東校區(qū)（在建）、巢湖校區(qū)、阜陽(yáng)校區(qū)等5個(gè)校（院）區(qū)，校園占地面積2086畝。有直屬教學(xué)機(jī)構(gòu)16個(gè)，直屬附屬醫(yī)院6所，非直屬附屬醫(yī)院9所。

現(xiàn)有在校全日制普通本科生12883 人，全日制研究生4130人，留學(xué)生434人，繼續(xù)教育學(xué)生17091人。在職教職醫(yī)護(hù)員工（含直屬附院）11532人，其中正高395人，副高1052人。校本部教職工1276人，專任教師717人，專任教師隊(duì)伍中具有博士、碩士學(xué)位的教師占92%，其中正高職稱123人，副高職稱293人。

學(xué)校以醫(yī)學(xué)為主，醫(yī)學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、管理學(xué)、法學(xué)等學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展。設(shè)有臨床醫(yī)學(xué)（“5+3”一體化）等33個(gè)本科專業(yè)。擁有臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)4個(gè)博士學(xué)位授權(quán)一級(jí)學(xué)科點(diǎn)，35個(gè)博士學(xué)位授權(quán)二級(jí)學(xué)科點(diǎn)；有13個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)一級(jí)學(xué)科點(diǎn)，63個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)二級(jí)學(xué)科點(diǎn)；擁有1個(gè)博士專業(yè)學(xué)位授予權(quán)學(xué)科，9個(gè)碩士專業(yè)學(xué)位授予權(quán)學(xué)科。臨床醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)和毒理學(xué)、分子生物學(xué)與遺傳學(xué)、生物與生物化學(xué)學(xué)科4個(gè)學(xué)科進(jìn)入ESI全球排名前1%。

學(xué)校建有藥學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)3個(gè)博士后科研流動(dòng)站。擁有1個(gè)國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科，2個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥重點(diǎn)學(xué)科，14個(gè)國(guó)家臨床重點(diǎn)?？平ㄔO(shè)項(xiàng)目，3個(gè)省級(jí)學(xué)科建設(shè)重大項(xiàng)目，18個(gè)省級(jí)重點(diǎn)學(xué)科，25個(gè)安徽省臨床重點(diǎn)專科。臨床醫(yī)學(xué)、藥理與毒理學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、生物學(xué)等5個(gè)學(xué)科獲安徽省屬公辦普通本科高校一流學(xué)科獎(jiǎng)補(bǔ)資金項(xiàng)目。建有3個(gè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，1個(gè)國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，32個(gè)省部級(jí)實(shí)驗(yàn)室。有1個(gè)教育部科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，2個(gè)安徽省科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，3個(gè)安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，3個(gè)安徽省高校科研創(chuàng)新平臺(tái)團(tuán)隊(duì)，1個(gè)安徽省高校智庫(kù)。

國(guó)家自然科學(xué)基金立項(xiàng)數(shù)連續(xù)15年保持省屬高校領(lǐng)先地位。研究成果分別入選2010、2014年度中國(guó)科學(xué)十大進(jìn)展和2012年度中國(guó)高?？萍际筮M(jìn)展。獲國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng)、教育部高等學(xué)校科學(xué)研究?jī)?yōu)秀成果獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)1項(xiàng)、中國(guó)青年科技獎(jiǎng)2項(xiàng)、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)4項(xiàng),安徽省自然科學(xué)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)4項(xiàng)、二等獎(jiǎng)5項(xiàng)。先后在《細(xì)胞》《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》《自然遺傳》等國(guó)際著名SCI刊物發(fā)表多篇高水平論文。

學(xué)校躋身國(guó)家“中西部高?；A(chǔ)能力提升工程”，是國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃承擔(dān)高校。有4個(gè)國(guó)家級(jí)高校特色專業(yè)建設(shè)點(diǎn)，2個(gè)國(guó)家級(jí)專業(yè)綜合改革試點(diǎn)，3個(gè)國(guó)家級(jí)卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃項(xiàng)目，1個(gè)國(guó)家級(jí)教學(xué)團(tuán)隊(duì)，2門國(guó)家級(jí)精品課程和2門國(guó)家級(jí)精品資源共享課，2個(gè)國(guó)家級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心，1個(gè)國(guó)家級(jí)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心，2個(gè)國(guó)家級(jí)示范性虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)項(xiàng)目。1門課程入選教育部來(lái)華留學(xué)英語(yǔ)授課品牌課程。獲得國(guó)家級(jí)教學(xué)成果二等獎(jiǎng)1項(xiàng)。

有35人次在國(guó)際學(xué)術(shù)組織和SCI源期刊任職。7人擔(dān)任國(guó)家級(jí)?？茖W(xué)會(huì)主委，12人入選教育部高校醫(yī)藥學(xué)科教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)專家。8人次擔(dān)任國(guó)家衛(wèi)健委“十三五”規(guī)劃教材主編。10余人獲得全國(guó)、全省模范教師、優(yōu)秀教師稱號(hào)。
學(xué)校編輯出版的具有CN刊號(hào)的醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)期刊有《安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》《中國(guó)藥理學(xué)通報(bào)》《臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志》《中華疾病控制雜志》等12種，其中CSCD核心期刊3種，北大核心期刊4種。

校圖書館藏書136萬(wàn)冊(cè)，是全國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)資源共享網(wǎng)絡(luò)安徽省級(jí)中心館，為安徽省高校數(shù)字圖書館醫(yī)學(xué)分中心、教育部科技查新工作站。

學(xué)校堅(jiān)持開(kāi)放、合作、共贏的方針，與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院、清華大學(xué)、中科院合肥物質(zhì)研究院、香港大學(xué)等建立戰(zhàn)略合作伙伴關(guān)系，與北京航空航天大學(xué)合作開(kāi)展醫(yī)工交叉創(chuàng)新研究，積極發(fā)展“新醫(yī)科”。目前臨床學(xué)院達(dá)50余所，實(shí)踐教學(xué)基地90余所，分布于安徽省各地市及北京、上海、江蘇、山東、浙江、廣東、福建、新疆等?。ㄊ?、自治區(qū)）。

學(xué)校同美國(guó)、德國(guó)、英國(guó)、俄羅斯、澳大利亞、加拿大、意大利、日本、西班牙、瑞典、馬來(lái)西亞、加納、埃塞俄比亞、韓國(guó)以及臺(tái)灣地區(qū)、香港地區(qū)等16個(gè)國(guó)家和地區(qū)的高等院校廣泛開(kāi)展合作交流與合作辦學(xué)，雙方互派專家學(xué)者、互派學(xué)生、相互交流信息資料、共同開(kāi)展人才培養(yǎng)和科研合作。

面向未來(lái)，安徽醫(yī)科大學(xué)始終把人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、社會(huì)服務(wù)、文化傳承創(chuàng)新、國(guó)際交流合作貫穿到辦學(xué)興校、立德樹(shù)人的全過(guò)程，努力實(shí)現(xiàn)建設(shè)高水平醫(yī)科大學(xué)的大擔(dān)當(dāng)、培育百千萬(wàn)良醫(yī)的大責(zé)任和服務(wù)人民群眾的大情懷的“安醫(yī)大發(fā)展之夢(mèng)”，到建校一百年時(shí)（2026年），成為走在全國(guó)同類高校前列的高水平醫(yī)科大學(xué)，到內(nèi)遷一百年時(shí)（2049年），成為國(guó)內(nèi)一流、國(guó)際知名的高水平醫(yī)科大學(xué)。